APC基因是種腫瘤抑制基因(tumor suppressor 
gene)，當APC基因發生突變時，它所轉譯的蛋白產物將
失去功能，而造成細胞病變，這與結腸癌的罹患率及預
後有密切關係。這些蛋白產物將造成大腸瘜肉的發生，
大腸瘜肉便是大腸癌的前身。因此對大腸瘜肉或大腸癌
的病人做APC基因的分析，有助於大腸癌的早期診斷與大
腸癌病人預後的評估。
  APC基因位於第五對染色體長臂（5q21-22）。共有15
個 exons。它所轉譯的蛋白共有2843個胺基酸，分子量
為 312KD。在構造上，APC的前端與所轉譯蛋白間的聚
合 (oligomerization) 有關，中間部分是與 catenin 
結合的部位有關，而尾端則是與 Tubulin 的結合部位有
關。一般而言，它主要作用有三:
  (1)細胞的結構。由免疫螢光染色的結果，顯示APC蛋
白會與細胞質中的microtubule 結合。一旦APC基因突
變，將造成蛋白合成截斷(truncation)，便無法與 
microtubule 結合。這將導致細胞結構發生變化。
  (2)調節細胞間的互動。目前已知道 β-catenin 有一
個重要功能是 β-catenin 會與 Cadherin 的細胞質部
份 (cytoplasmic domain) 結     合。因此，一旦 
APC 基因在中段部份發生突變，會造成 APC 基因與 β-
catenin 的結合力發生變化，將導致細胞間的黏著能
力，或接觸性抑制 (contact inhibition) 發生異常。
誠如大家所知，癌症的一大特徵是細胞彼此間黏著力的
異常。
  (3)調節DNA 的轉譯（transcription）。當 APC 蛋白
正常時。細胞質中的β-catenin 會與 APC 蛋白結合，
所以它的濃度相當低;可是一旦APC 發生突變時，則 β-
catenin 的濃度會上升，然後它會與 Tcf (T-cell 
transcription factor) 蛋白結合，而造成下游基因的
不正常表現。因此。APC在功能上可以視為一種抑癌基
因 (tumor suppressor gene)。
  此外，目前也有研究顯示 APC 蛋白會透過促進成熟大
腸黏膜細胞的凋亡(apoptosis)，而使得大腸黏膜細胞的
汰舊速度加快。一旦 APC 基因發生突變，則大腸黏膜細
胞族群便不發生凋亡而逐漸旺盛，而最終造成腫瘤的
發生。
  值得一提的是 APC 突變是作用在「腺瘤一腺癌順序」
的起始步驟，因 APC 突變的比例在腺瘤和腺癌中相近。
再者，在前述的黏膜隱窩構造紊亂 (aberrant crypt 
foci, ACF) 的基因分析中發現：在分化不良的 ACF 
中， APC 突變率高達85%，而分化良好的 ACF 中， 
APC 的突變率為0。至於 Kras 基因在分化不良與分化良
好的 ACF 中的比例，則約略相等(各25%)此一證據表示
 APC 的突變才是「腺瘤一腺癌順序」的引發步驟。
  目前大概已鑑定出超過450種以上的 APC 突變型態，
而大部份的 APC突變發生在中段三分的一的部位。 
Exonl5G 是目前知道的一個突變好發點 (hotspot)，此
地的突變會造成大腸產生數目上千個息肉。且這些很高
的機會會轉變成癌症，此即典型的 FAP。
  目前知道 FAP 基因中段的突變最常見者為 
tuncation mutation，即突變造成 stop codon。而且 
FAP 的對偶基因中段有一發生突變，則所合成的不正常
 APC 蛋白會與正常 APC 蛋白結合而壓抑它作用。此即
dominant negative 作用。而一些較輕微的息肉症
 (attenuated polyposis)，即息肉數目較少，且轉變成
癌的速度較慢的類型，則突變的位置是在 exon3和4，以
及exonl5的3’端。這些表現型與基因型的關連情況
(genotype-phenotype correlations) 可以指引臨床醫
師去尋找息肉症病患的基因變化，更充分了解各類型息
肉症的預後情況，而施予最佳的治療。